Исследователи нашли в коронавирусе SARS-CoV-2 загадочный «ген в гене». Почему это важно?

11 ноября, 10:36
Цей матеріал також доступний українською
issledovateli nashli v koronaviruse sars cov 2 zagadochnyj gen v gene pochemu eto vazhno 5fabac8f58d6e - Исследователи нашли в коронавирусе SARS-CoV-2 загадочный «ген в гене». Почему это важно?

Открытие нового гена SARS-CoV-2 может изменить терапию (Фото: NIAID/NIH)

Американские биологи нашли загадочный ген в коде коронавируса SARS-CoV-2. Этот сегмент был скрыт в геноме вируса и его упускали из виду.

Хроники коронавируса. Последние новости

Все об эпидемии коронавируса в мире и карантин в Украине

Отправляем ежедневно в 08:00

Недавно идентифицированный ген, названный ORF3d, является примером так называемого перекрывающегося гена. Он скрывается в цепочке нуклеотидов из-за того, что перекрывает закодированные последовательности других генов, отметили авторы открытия.

«С точки зрения размера генома SARS-CoV-2 и его родственники являются одними из самых длинных существующих РНК-вирусов. Таким образом, они, возможно, более подвержены геномному обману, чем другие РНК-вирусы», — объясняет биоинформатик Чейз Нельсон из Американского музея естественной истории.

На самом деле вирусы весьма склонны к тому, что у них перекрываются гены, так что это не совсем шокирующее открытие.

Перекрывающиеся гены сложно идентифицировать в генетических последовательностях, поскольку системы геномного сканирования часто могут пропускать их при просмотре строк генетического кода: они запрограммированы на выбор отдельных генов, но не обязательно видят общие инструкции, общие для нуклеотидов соседних генов в последовательности.

В контексте таких вирусов, как SARS-CoV-2, это может создать серьезную слепую зону. Ученые с начала этого года стремятся понять как можно больше об этом разрушительном вирусе, и хотя некоторые аспекты его генетической структуры были выяснены, многого мы просто еще не знаем.

«Отсутствие перекрывающихся генов подвергает нас опасности упустить из виду важные аспекты вирусной биологии. Перекрывающиеся гены могут быть одним из арсенала способов, которыми коронавирусы эволюционировали для подрыва иммунитета хозяина или передачи самих себя», — говорит Нельсон.

Просканировав геномные базы данных, исследователи обнаружили, что ген был идентифицирован ранее, но только в одном варианте коронавируса, поражающем панголинов (обнаружен в Гуанси, Китай).

Ранее он также был ошибочно классифицирован как неродственный ген ORF3b, который присутствует в других коронавирусах, включая SARS-CoV, но на самом деле это не одно и то же.

«Эти два гена не связаны и кодируют совершенно разные белки», — говорит Нельсон.

Единственное, что мы знаем о загадочном гене, основываясь на предыдущем анализе крови пациентов с COVID-19, — это то, что ORF3d действительно вызывает сильный ответ антител. Для вируса, который имеет всего около 15 известных генов, открытие еще одного является значительным достижением. Насколько это важно для лечения COVID-19, теперь попытаются выяснить ученые.

Ранее НВ писал, что ученые из Королевского колледжа Лондона опубликовали результаты исследования, согласно которым ДНК человека влияет на проявление разных симптомов коронавируса. В работе исследователи использовали данные о близнецах с идентичным генетическим кодом.

Исследование ученых из Великобритании показало, что «на восприимчивость к инфекции SARS-CoV-2 может влиять генотип ее носителя». Иными словами, ученые подтвердили, что проявление тяжелых симптомов коронавируса частично зависит от определенного набора генов пациентов с COVID-19.

Команда медиков использовала специальное мобильное приложение, с помощь которого в Великобритании собирают данные о людях с COVID-19. Сообщается, что в этом приложении зарегистрированы около 2,7 млн пользователей, многие из которых прошли тест на коронавирус и поделились своими симптомами болезни.

С помощью технологий машинного обучения эксперты проанализировали данные о примерно 2600 близнецах, которые также рассказали о своих симптомах болезни.